...
Er is dus geen invoerbestand nodig voor het maken van compound structures, maar in de workflow (bijvoorbeeld een JuPyTeR-notebook zoals in het voorbeeld op GitHub) wordt een genestte geneste lijst gedefinieerd, waarvan de lengte het aantal compound structures is, met in de de sub-lijsten de codes van de structures die moeten worden opgenomen. Ook is er een lijst met de IDs van de compound structures met dezelfde lengte. In genoemd voorbeeld van een workflow is ook een voorbeeld van een compound structure opgenomen:
...